De enero de 2018 a la fecha, la Defensoría de los Derechos Humanos del Pueblo de Oaxaca (DDHPO) ha iniciado 76 expedientes de quejas y 7 cuadernos de antecedentes relacionados con quejas por intolerancia religiosa.
De acuerdo a los registros del organismo estatal, del total de expedientes de queja, 15 son de 2018, 27 de 2019, nueve de 2020, siete de 2021, 10 de 2022 y ocho de 2023. En cuadernos de antecedentes, solo en 2018 y 2019 se reportaron seis y un caso, respectivamente.
En 2018 las instituciones más señaladas fueron los ayuntamientos, como Santa María Zacatepec y Santiago Choapam, en la violación de los derechos a la seguridad jurídica, a la libertad y seguridad personales y a la libertad de conciencia y religión.
En 2019, los más señalados fueron el Instituto Estatal de Educación Pública de Oaxaca (IEEPO) y los ayuntamientos como San Juan Lalana, Ejutla de Crespo y Santiago Jocotepec, Choapam, con la violación a los derechos a la libertad de conciencia, religión y legalidad.
En 2020, 2021 y 2022, los ayuntamientos más señalados fueron Santa María Ozolotepec, San Jerónimo Coatlán y San Mateo del Mar, con la violación a la libertad de conciencia y religión, a la libertad deambulatoria y en el contexto de los sistemas normativos internos.
En el presente año, de acuerdo a la Defensoría, también hubo quejas y cuadernos de antecedentes contra varios municipios, por la violación a la libertad de conciencia, religión y la legalidad.
De acuerdo al Gobierno del Estado, en 2022 un gran número de conflictos de carácter religioso se concentran sobre todo en la Costa, seguido por el Istmo de Tehuantepec y Cuenca del Papaloapan, Sierra Norte, por orden de importancia.
En varias comunidades del estado, varias familias que profesan la religión cristiana o evangelista son objeto de discriminación por las asambleas de los pueblos, las cuales determinan dejarlos sin los servicios básicos o expulsarlos de la zona por esta razón.